马龙县位于滇中和滇东的结合部，地处东经103°16′～103°45′、北纬25°08′～25°37′之间。东与麒麟区接壤，南与陆良县相连，西南与宜良县毗邻，西面及北面与嵩明、寻甸、沾益三县交界。东西最大距离47.25公里，南北最大跨度44.5公里，总面积1614平方公里。县城通泉镇，海拔2034米，距省会昆明113公里，距曲靖市区22公里。
马龙地势东南高峻，中部隆起向西北倾斜呈阶梯状下降，四面环山，中间山谷、丘陵、河流纵横，由七条分别流入长江水系和珠江水系的河流分割为11个8平方公里以上的小坝子。最高点南部纳章镇与陆良县交界的牛头山海拔2493米，最低点西南部马鸣乡小密得河海拔1772.2米，平均海拔2132米。马龙县属低纬度高原季风气候。特点是冬无严寒，夏无酷暑，干冷同期，雨热同季。年平均气温13.6℃，年均降雨量1001.8毫米，年均日照2158小时，年均相对湿度75％，年均无霜期247天。
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